5 分类类型
科
7 藻类DNA病毒科成员
属 | 种 |
绿藻病毒属(Chlorovirus) | 绿藻病毒属(Chlorovirus) |
小球藻病毒1型(Paramecium bursaria Chlorella virus 1) | |
小球藻病毒AL1A型(Paramecium bursaria Chlorella virus AL1A) | |
小球藻病毒AL2A型(Paramecium bursaria Chlorella virus AL2A) | |
小球藻病毒BJ2C型(Paramecium bursaria Chlorella virus BJ2C) | |
小球藻病毒CA4A型(Paramecium bursaria Chlorella virus CA4A) | |
小球藻病毒CA4B型(Paramecium bursaria Chlorella virus CA4B) | |
小球藻病毒IL3A型(Paramecium bursaria Chlorella virus IL3A) | |
小球藻病毒NC1A型(Paramecium bursaria Chlorella virus NC1A) | |
小球藻病毒NE8A型(Paramecium bursaria Chlorella virus NE8A) | |
小球藻病毒NY2A型(Paramecium bursaria Chlorella virus NY2A) | |
小球藻病毒Nys1型(Paramecium bursaria Chlorella virus NYs1) | |
小球藻病毒SC1A型(Paramecium bursaria Chlorella virus SC1A) | |
小球藻病毒XY6E型(Paramecium bursaria Chlorella virus XY6E) | |
小球藻病毒X23A型(Paramecium bursaria Chlorella virus XZ3A) | |
小球藻病毒X24A型(Paramecium bursaria Chlorella virus XZ4A) | |
小球藻病毒X24C型(Paramecium bursaria Chlorella virus XZ4C) | |
小球藻病毒AI型(Paramecium bursaria Chlorella virus A1) | |
水螅绿藻病毒1型(Hydra viridis Chlorella virus 1) | |
小球藻病毒AL2C型(Paramecium bursaria Chlorella virus AL2C) | |
小球藻病毒CA1A型(Paramecium bursaria Chlorella virus CA1A) | |
小球藻病毒CA1D型(Paramecium bursaria Chlorella virus CA1D) | |
小球藻病毒CA2A型(Paramecium bursaria Chlorella virus CA2A) | |
小球藻病毒IL2A型(Paramecium bursaria Chlorella virus IL2A) | |
小球藻病毒IL2B型(Paramecium bursaria Chlorella virus IL2B) | |
小球藻病毒IL3D型(Paramecium bursaria Chlorella virus IL3D) | |
小球藻病毒IL5-2s1型(Paramecium bursaria Chlorella virus IL5-2s1) | |
小球藻病毒MAID型(Paramecium bursaria Chlorella virus MA1D) | |
小球藻病毒MA1E型(Paramecium bursaria Chlorella virus MA1E) | |
小球藻病毒NC1B型(Paramecium bursaria Chlorella virus NC1B) | |
小球藻病毒NC1C型(Paramecium bursaria Chlorella virus NC1C) | |
小球藻病毒NC1D型(Paramecium bursaria Chlorella virus NC1D) | |
小球藻病毒NE8D型(Paramecium bursaria Chlorella virus NE8D) | |
小球藻病毒NY2B型(Paramecium bursaria Chlorella virus NY2B) | |
小球藻病毒NY2C型(Paramecium bursaria Chlorella virus NY2C) | |
小球藻病毒NY2F型(Paramecium bursaria Chlorella virus NY2F) | |
小球藻病毒Nyb1型(Paramecium bursaria Chlorella virus NYb1) | |
小球藻病毒SC1B型(Paramecium bursaria Chlorella virus SC1B) | |
小球藻病毒SH6A型(Paramecium bursaria Chlorella virus SH6A) | |
小球藻病毒XZ26C型(Paramecium bursaria Chlorella virus XZ5C) | |
小球藻病毒CVBII型(Paramecium bursaria Chlorella virus CVBII) | |
小球藻病毒CVK2型(Paramecium bursaria Chlorella virus CVK2) | |
小球藻病毒CVUI型(Paramecium bursaria Chlorella virus CVU1) | |
小球藻病毒BI型(Paramecium bursaria Chlorella virus B1) | |
小球藻病毒GI型(Paramecium bursaria Chlorella virus G1) | |
小球藻病毒MI型(Paramecium bursaria Chlorella virus M1) | |
小球藻病毒RI型(Paramecium bursaria Chlorella virus R1) | |
水螅绿藻病毒2型(Hydra viridis Chlorella virus 2) | |
水螅绿藻病毒3型(Hydra viridis Chlorella virus 3) | |
青绿藻病毒属(Prasinovirus) | 细小微单胞藻病毒SP1(Micromonas pusilla virus SP1) |
细小微单胞藻病毒SP2(Micromonas pusilla virus SP2) | |
细小微单胞藻病毒GM1(Micromonas pusilla virus GM1) | |
细小微单胞藻病毒PB8(Micromonas pusilla virus PB8) | |
细小微单胞藻病毒SG1(Micromonas pusilla virus SG1) | |
细小微单胞藻病毒PB7(Micromonas pusilla virus PB7) | |
细小微单胞藻病毒PB6(Micromonas pusilla virus PB6) | |
细小微单胞藻病毒PL1(Micromonas pusilla virus PL1) | |
定鞭藻病毒属(Prymnesiovirus) | 短丝金藻病毒PWI(Chysochromulina brevifilum virus PW1) |
短丝金藻病毒PW3(Chysochromulina brevifilum virus PW3) | |
球形棕囊藻病毒-01T型(Phaeocystis globosa virus 1(Texel)) | |
球形棕囊藻病毒-02T型(Phaeocystis globosa virus 2(Texel)) | |
球形棕囊藻病毒-03T型(Phaeocystis globosa virus 3(Texel)) | |
球形棕囊藻病毒-04T型(Phaeocystis globosa virus 4(Texel)) | |
球形棕囊藻病毒-05T型(Phaeocystis globosa virus 5(Texel)) | |
球形棕囊藻病毒-06T型(Phaeocystis globosa virus 6(Texel)) | |
球形棕囊藻病毒-07T型(Phaeocystis globosa virus 7(Texel)) | |
球形棕囊藻病毒-08T型(Phaeocystis globosa virus 8(Texel)) | |
球形棕囊藻病毒-09T型(Phaeocystis globosa virus 9(Texel)) | |
球形棕囊藻病毒-10T型(Phaeocystis globosa virus 10(Texel)) | |
球形棕囊藻病毒-11T型(Phaeocystis globosa virus 11(Texel)) | |
球形棕囊藻病毒-12T型(Phaeocystis globosa virus 12(Texel)) | |
球形棕囊藻病毒-13T型(Phaeocystis globosa virus 13(Texel)) | |
球形棕囊藻病毒-14T型(Phaeocystis globosa virus 14(Texel)) | |
球形棕囊藻病毒-15T型(Phaeocystis globosa virus 15(Texel)) | |
球形棕囊藻病毒-16T型(Phaeocystis globosa virus 16(Texel)) | |
球形棕囊藻病毒-17T型(Phaeocystis globosa virus 17(Texel)) | |
球形棕囊藻病毒-18T型(Phaeocystis globosa virus 18(Texel)) | |
球形棕囊藻病毒-102P型(Phaeocystis globosa virus 102(Polmouth)) | |
褐藻病毒属(Phaeovirus) | 束生水云褐藻病毒a型(Ectocarpus fasciculatus virus a) |
长囊水云褐藻病毒I型(Ectocarpus siliculosus virus 1) | |
长囊水云褐藻病毒a型(Ectocarpus siliculosus virus a) | |
异费氏褐藻病毒a型(Feldmannia irregularis virus a) | |
费氏褐藻病毒(Feldmannia species virus) | |
费氏褐藻病毒a型(Feldmannia species virus a) | |
痕克褐藻病毒a型(Hincksia hinckiae virus a) | |
多毛褐藻病毒a型(Myriotrichia clavaeformis virus a) | |
海滨球螺藻病毒a(Pilayella littoralis virus a) | |
球石藻病毒属(Coccoliithovirus) | 赫胥黎艾氏藻病毒86(Emiliania huxley virus 86) |
赫胥黎艾氏藻病毒163(Emiliania huxley virus 163) | |
赫胥黎艾氏藻病毒201(Emiliania huxley virus 201) | |
赫胥黎艾氏藻病毒202(Emiliania huxley virus 202) | |
赫胥黎艾氏藻病毒203(Emiliania huxley virus 203) | |
赫胥黎艾氏藻病毒205(Emiliania huxley virus 205) | |
赫胥黎艾氏藻病毒207(Emiliania huxley virus 207) | |
赫胥黎艾氏藻病毒208(Emiliania huxley virus 208) | |
赫胥黎艾氏藻病毒2KB1(Emiliania huxley virus 2KB1) | |
赫胥黎艾氏藻病毒2KB2(Emiliania huxley virus 2KB2) | |
赫胥黎艾氏藻病毒84(Emiliania huxley virus 84) | |
赫胥黎艾氏藻病毒88(Emiliania huxley virus 88) | |
赫胥黎艾氏藻病毒99B1(Emiliania huxley virus 99B1) | |
针胞藻病毒属(Raphidovirus) | 赤潮异弯藻病毒01型(Heterosigma akashiwo virus 01) |
赤潮异弯藻病毒02型(Heterosigma akashiwo virus 02) | |
赤潮异弯藻病毒03型(Heterosigma akashiwo virus 03) | |
赤潮异弯藻病毒04型(Heterosigma akashiwo virus 04) | |
赤潮异弯藻病毒05型(Heterosigma akashiwo virus 05) | |
赤潮异弯藻病毒06型(Heterosigma akashiwo virus 06) | |
赤潮异弯藻病毒07型(Heterosigma akashiwo virus 07) | |
赤潮异弯藻病毒08型(Heterosigma akashiwo virus 08) | |
赤潮异弯藻病毒09型(Heterosigma akashiwo virus 09) | |
赤潮异弯藻病毒10型(Heterosigma akashiwo virus 10) | |
赤潮异弯藻病毒11型(Heterosigma akashiwo virus 11) | |
赤潮异弯藻病毒12型(Heterosigma akashiwo virus 12) | |
赤潮异弯藻病毒13型(Heterosigma akashiwo virus 13) | |
赤潮异弯藻病毒14型(Heterosigma akashiwo virus 14) | |
赤潮异弯藻病毒15型(Heterosigma akashiwo virus 15) | |
- | 金球藻病毒(Aureococcus anophagefference virus ) |
- | 金色藻病毒01B型(Chrysochromulina ericina virus 01B) |
- | 赤潮甲藻病毒01型(Heterocapsa circularisquama virus 01) |
- | 赤潮甲藻病毒02型(Heterocapsa circularisquama virus 02) |
- | 赤潮甲藻病毒03型(Heterocapsa circularisquama virus 03) |
- | 赤潮甲藻病毒04型(Heterocapsa circularisquama virus 04) |
- | 赤潮甲藻病毒05型(Heterocapsa circularisquama virus 05) |
- | 赤潮甲藻病毒06型(Heterocapsa circularisquama virus 06) |
- | 赤潮甲藻病毒07型(Heterocapsa circularisquama virus 07) |
- | 赤潮甲藻病毒08型(Heterocapsa circularisquama virus 08) |
- | 赤潮甲藻病毒09型(Heterocapsa circularisquama virus 09) |
- | 赤潮甲藻病毒10型(Heterocapsa circularisquama virus 10) |
- | 棕囊藻病毒01型(Phaeocystis pouchetii virus 01) |
- | 塔胞藻病毒01B型(Pyramimonas orientalis virus 01B) |
8 藻类DNA病毒科病毒形态学特性
病毒粒子均为多角体粒子,粒子是由一个电子密度致密的核以及包裹多层蛋白外壳组成。病毒粒子的外层并不存在一层膜,壳体的直径在130-190nm之间,一些电子显微镜照片显示,病毒粒子在其肿胀结构的末端有着头发一样的附属物,这些附属物至少存在于病毒粒子的一些顶端,每个病毒粒子含有20-25nm的突起结构。
9 藻类DNA病毒科病毒生理化学和物理性质
绿藻病毒属的代表种PBCV-1的分子量为1×109Da,S20W 约高于2000S。当CsCl密度梯度离心时,绿藻病毒属的成员的病毒粒子会被破坏。绿藻病毒属病毒粒子的感染性不被非离子去污剂破坏,但有机溶剂能使其失活。
10 藻类DNA病毒科病毒的核酸
真核藻类病毒粒子具有很大的dsDNA基因组,其范围为160-380kbp,绿藻病毒属的具有线性的,不交叉的dsDNA基因组,其末端是交叉的发夹结构。DNA的末端,都包含相同的1-2.2kbp长度的重复,剩余的基因组大都是单拷贝的的DNA,褐藻病毒属成员的基因组是环形dsDNA,并且其中的一些成员包含延伸了的单链区域。褐藻病毒属成员的基因组可以整合入宿主的基因组,病毒粒子的G+C%含量为40-52%,几乎所有成员的DNA都有甲基化的碱基,基本上都在胞嘧啶5位的C和腺嘌呤6位的N上。绿藻病毒属的成员的碱基甲基化的比例从不含6mA和0.1%5mC到37%的6mA和47%的5mC。
11 藻类DNA病毒科病毒的蛋白质
纯化了的病毒粒子至少包含50种或更多种类的蛋白质,其分子量的范围大约为10-20×103Da,绿藻病毒属的代表中PBCV-1具有三种糖蛋白,三种肉豆蔻酰化蛋白(主要的衣壳蛋白Vp54,同时被糖基化和肉豆蔻酰化),一些磷酸化的蛋白质。四种蛋白质,包括Vp54,都定位于病毒粒子的表面。
13 藻类DNA病毒科病毒的碳水化合物
绿藻病毒属PBCV-1至少有三种蛋白质被糖基化,包括主要的外壳蛋白Vp54。Vp54被糖基化的部分位于病毒粒子的外表面。不像其他未知病毒,PBCV-1好像至少编码一些糖基化的酶。
14 基因组结构和基因组的复制
绿藻病毒属PBCV-1的的基因组的序列已经被测定,基因组的大小为333.747kb,此病毒共编码701个开放型阅读框,据预测,其中的376个开放型阅读框编码的是蛋白质。大约有40%的开放型阅读框在数据库中能找到相对应的蛋白质。PBCV-1的两个基因中有内含子插入:一个像基因一样的转录因子具有自我剪接Ⅰ型的内含子,另一个为DNA聚合酶基因剪接体型的内含子。PBCV-1同样也编码10个tRNA基因,其中的一个含有小的内含子。细胞内的病毒DNA复制的情况还不清楚,DNA的包装出现在细胞质内的特定区域,病毒的转录可能出现在细胞核内,因为PBCV-1并不编码明显的DNA指导的RNA聚合酶。
15 藻类DNA病毒科病毒的宿主范围和传播途径
藻类DNA病毒科根据其感染淡水藻类或海藻的不同,可分别在遍布世界各地的淡水或海水中收集到。病毒具宿主专一性,只感染藻类的单一分离株。例如,绿藻病毒属成员仅吸附单细胞、真核类小球藻属绿藻的细胞壁,细胞壁在吸附点溶解,病毒DNA和相关病毒蛋白进入细胞,空病毒衣壳留在细胞表面。开始感染后2-4小时,病毒粒子在细胞质中装配。病毒释放前30-40分钟,感染细胞中可检测到感染性病毒粒子,病毒通过细胞裂解释放。
细小微胞寄生藻病毒属成员感染时,病毒吸附在无细胞壁的宿主细胞表面,接近的病毒和细胞表面融合,释放核心物质后病毒衣壳留在宿主细胞表面,从吸附阶段起,侵入过程大约需3小时,病毒一个生长循环需要14小时。在复制循环中,病毒颗粒在细胞质中出现,与健康细胞中缺乏的细胞质丝(直径5-8nm)及膜结合空泡串相关联。病毒粒子释放进入位于细胞膜断裂的介质,断裂通常在同一细胞的几个位置出现。