反转录转座子

反转录转座子

除反转录病毒外，反转录转座子可以分成两类：一类是病毒超家族(viralsuperfamily)，这类反转录转座子编码反转录酶或整合酶(integrases)，能自主地进行转录，其转座的机制同反转录病毒相似，但不能像反转录病毒那样以独立感染的方式进行传播；

长散在重复序列

长散在重复序列(10nginterspersednuclearelements，LINE)，意为散在分布的长细胞核因子，是散在分布在哺乳动物基因中的一类重复序列，这种重复序列较长；L1以及由L1编码的反转录酶作用于其他非自主反转录转座子以后所生成的DNA序列，加起来至少占人类基因组全长的四分之一。许多真核细胞中都发生3'转导作用。

重复序列家族

重复序列家族(sequencefamily)是指一类核苷酸序列高度相似的重复序列，这些重复序列包括基因和基因以外的序列。真核生物基因组中来源相同、结构相似、功能相关的一组基因可归为一个基因家族(genefamily)。重复序列主要是基因以外的DNA序列。根据其在基因组中的组织形式，可分为串联重复序列和散在重复序列。

漂移病毒属

果蝇gypsy病毒基因组分子大小为7469bp，其中包括两个482bp的LTR。基因组RNA含有一个编码主要结构蛋白的ORF；这种蛋白是反转录蛋白囊膜蛋白的类似物，它通过疏水跨膜区域位于病毒膜，加工位点与跨膜和表面区域的切割相似。在转座子的中部还含有若干开读框（ORF），与反转录病毒的gag，pol及env基因同源。

转座因子

最明显的效应是转座子能够启动重组，最后导致基因组重排。反转录转座因子的转座作用可以引起非编码序列DNA的重排，当基因组的一段DNA序列在RNA聚合酶的作用下产生其RNA拷贝，然后在反转录酶催化下，以这个RNA为模板合成DNA拷贝，然后插入基因组的其他部位，由此既增加了基因组的大小，又增加了重复序列。